Знание того, как эволюционирует ковид, нужно для прогнозирования прорывных инфекций и создания вакцин, устойчивых к мутациям. В новой научной работе, размещенной в журнале ACS Infectious Diseases, эксперты рассмотрели порядка 1,5 миллиона геномных последовательностей SARS-CoV-2, которые были взяты у людей с COVID-19. Они определили 683 уникальные мутации в домене связывания рецептора (RBD) - области шиповидного белка SARS-CoV-2, который присоединяется к рецептору ACE2 на поверхности клеток человека.
После этого ученые использовали модель искусственного интеллекта, чтобы рассмотреть, как данные мутации оказывают влияние на прочность связывания RBD с ACE2 и на 130 структур антител, в частности несколько моноклональных антител, которые используются в качестве терапии. Оказалось, что мутации, которые усиливают заразность, являются движущей силой вирусной эволюции, в то время как в популяциях с высоким уровнем вакцинации преобладают мутации, которые позволяют вирусу избегать вакцин. Исследователи также предсказали, что некоторые комбинации мутаций имеют высокий риск массового распространения, сообщает UfaTime.ru со ссылкой на MedicalXpress.
В другом исследовании, размещенном в Journal of Chemical Information and Modeling, ученые рассмотрели инфекционность «омикрона», прорывные инфекции и устойчивость к антителам. Они использовали модель искусственного интеллекта, чтобы рассмотреть, как необычно большое количество мутаций штамма в белке-шипе оказывает влияние на связывание RBD с ACE2 и антителами. Итоги продемонстрировали, что «омикрон» более чем в десять раз заразнее исходного коронавируса и в 2,8 раза – «дельта»-варианта.